中华肿瘤杂志

北大核心,CA,JST,CSCD,WJCI

国内刊号:11-2152/R

国际刊号:0253-3766

中华肿瘤杂志2021年第03期:垂体瘤转化基因1在胃腺癌组织中的表达及其与患者预后的关系

发布日期:

作者:姚宁华,陈志明,石宇,严晓娣,吕丽婷,刘静,宣婷婷,钱静,赵洪瑜

关键词:生物信息;胃肿瘤;预后;垂体瘤转化基因1

基金:国家青年基金E81602010

目的 鉴定胃腺癌新的预后标志物和治疗靶点。方法 通过Gene Expression Omnibus(GEO)数据库下载GSE33335和GSE63089基因表达数据集,共含有70例胃腺癌组织和配对的胃正常组织基因芯片数据,使用R语言分析胃癌组织和胃正常组织间差异表达基因。通过String在线分析工具构建差异表达基因的蛋白-蛋白相互作用(PPI)网络。使用Cytoscape软件和分子复合物检测(MCODE)插件分离出关键基因集。使用在线数据库鉴定分离出与预后相关的关键基因,分别用数据库信息和南通大学附属医院2019年7—9月收治的32例胃腺癌组织和癌旁正常组织从mRNA和蛋白水平进行验证。结果 使用R语言分析显示,2个数据集中有128个共同差异表达基因,其中85个基因在胃腺癌组织中表达上调,43个基因在胃腺癌组织中表达下调。通过String在线工具和Cytoscape软件建立了PPI网络和MCODE模型,获得27个关键基因,其中有25个基因与胃腺癌患者的预后有关( <0.05)。25个与预后相关的基因中,有14个基因在胃腺癌组织中表达显著,其中有3个基因[垂体瘤转化基因1(PTTG1)、细胞周期蛋白B1(CCNB1)和polo样激酶1(PLK1)]在细胞周期途径中显著富集。PTTG1在胃腺癌和胃正常组织中的阳性表达率分别为68.8%(22/32)和18.8%(6/32),差异有统计学意义( <0.05)。 结论 PTTG1在胃腺癌组织和胃正常组织中存在表达差异,是胃腺癌形成的关键基因。过表达PTTG1的胃腺癌患者预后更差。PTTG1可能通过调控细胞周期参与胃腺癌的发生发展。

来源:2021年第03期

《中华肿瘤》期刊编辑部

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